Projekt Aiscra

Jaki problem chcemy rozwiązać?

Dokowanie molekularne będące metodą modelowania molekularnego polegającą na poszukiwaniu optymalnego sposobu wiązania liganda w strukturze receptora (oddziaływania liganda z receptorem), jest obecnie jedną z najpowszechniej stosowanych metod projektowania leków. Niestety nie gwarantuje jednoznacznych wyników, a jej skuteczność zależy od poprawności przeprowadzenia procedury oraz interpretacji wyników. Proces analizy wyników i wyboru najbardziej obiecujących związków chemicznych jest żmudny i wymaga ekspertyzy w wielu dziedzinach, takich jak chemia medyczna i obliczeniowa, a także znajomości obsługi specjalistycznego oprogramowania komputerowego.

Nasze rozwiązanie

Realizowany projekt polegać będzie na przygotowaniu platformy Aiscra, której celem jest uproszczenie i zautomatyzowanie kluczowych kroków na drodze od przeprowadzenia dokowania molekularnego do wyboru najbardziej obiecujących kandydatów do testów laboratoryjnych. Interakcja z platformą będzie odbywać się przez rozmowę z wirtualnym asystentem, który umożliwi łatwą konfigurację poszczególnych narzędzi cheminformatycznych przy użyciu poleceń sformułowanych w języku naturalnym. Wśród narzędzi zintegrowanych w platformie znajdzie się analiza jakości pozycji ligandów, przewidywanie własności molekularnych kluczowych na wczesnych etapach projektowania leków, filtrowanie przewidzianych pozycji pod kątem preferowanych oddziaływań z białkiem, a nawet automatyczne generowanie analogów analizowanych związków chemicznych. Efektem analizy przeprowadzonej z użyciem platformy Aiscra będzie wybór związków w taki sposób, aby zmaksymalizować prawdopodobieństwo znalezienia trafień oraz zminimalizować ryzyko niepowodzenia kolejnych etapów procesu projektowania leków. Skuteczność działania platformy zostanie zweryfikowana przez testy biochemiczne i eksperymenty krystalograficzne.

Skontaktuj się z nami

Jeśli masz jakiekolwiek pytania na temat naszego projektu, albo chciałbyś pomóc budować lub testować nasze rozwiązanie, wyślij nam wiadomość na adres tomasz.danel@uj.edu.pl.

Podziękowania

Projekt finansowany przez Narodowe Centrum Badań i Rozwoju w ramach programu LIDER XV.